报关单复核最好设两个复核岗位，第一个岗位复核完毕后，报关单流转到报关经理或主管处，他们对报关单的申报是否正确负有最终的责任。大型企业或进出口公司每天上百份报关单，对于每一份报关单都从头至尾看一遍显然是不切实际。通常可以两种方法加快复核速度，第一是抽查报关单内容，对每一份报关单中数量最大及最小的项目，对金额最大及最小的项目，重量最大及最小的项目进行抽查确认。这种抽查方法可以迅速确认报关单中是否有申报异常的项目。第二是逻辑检查，对币制为美元以外的外币如日元，韩元等重点检查币制是否错误。对原产国进行检查，看是否有不知名或很少见的国家名，检查原产国是否正确。对运保费进行检查，看是否和随附单据的运保费一致。对包装内容进行检查，看是否有木质包装未申报。最后对特殊关系申报和知识产权申报勾选项进行确认。
至于商品编码和规范申报等重要内容，企业应事先建立数据库，自动导入报关单内，无需再进出口前再检查。另外对于旧机电进出口，涉及许可证的进出口，特殊的监管方式的报关单，由于报关员平时做此类单较少，容易出错，报关经理和主管要重点确认这些报关单。


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