2022年12月，武汉某知名的公用型保税仓库接受海关稽查，被发现存在重大的在库误差。海关物流账册中显示某型号电脑的库存为负数1万台，实际库存为零。另有其他型号的电脑库存为数万台，但实际库存都为零。保税仓库一进一出，没有单耗损耗，为什么会出现上述的在库误差呢？经过海关核查和企业内部调查，发现了造成在库误差的原因。
第一是物流账册多个序号项下的商品是同类商品，出库时串用了序号报关。第二是入库数量多报，报关入库的商品实际上未入库。或使用了修改后的进口核注清单入库，但原来的进口核注清单没有及时删除。第三是核注清单申报错误，进口申报数量和实际入库数量不一致。第四是核注清单未正常核扣。货物已经实际入库，但进口核注清单未正常核扣，造成物流账册在库数量未增加。以上四种原因造成了在库误差，货物实际上并无短少和灭失的情况。但该公用型保税仓库仍因申报不实影响海关监管秩序而被处罚。
申报不实只是表面的原因，实际上该仓库真正的问题在于没有妥善管理保税货物，进出口没有复核体制，日常也没有对账册在库和实际在库进行比对。如果不在管理上进行整改，类似的错误还会继续的发生。


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